1 августа 1803 года первый провинциальный музей России открыл свои двери. На его фронтоне золотом высечено: «Великому Петру усердный Переславль». В 1842 года была возведена каменная сторожка – караульное помещение для отставных матросов, охранявших музей. Также построена ротонда – здание для общественных приемов и танцев. Кроме того, на территории появилась триумфальная арка. С сооружением Белого дворца в 1853 году усадьба «Ботик Петра I» приобрела свой окончательный архитектурный облик. В 1919 году стала филиалом Переславского музея.
Действуют постоянные экспозиции: