Постоянные экспозиции: «Серебряная кладовая» (русское декоративно-прикладное искусство XVI-XIX вв. (ризница), «Деревянная скульптура и резьба XVI-XIX вв.», «Древнерусское искусство (иконы) XV-XVIII вв.», «Русская живопись XVIII-XX вв.», «Искусство русской деревни», «Венок усадьбам», мемориальные экспозиции Ф.И. Шаляпина и Д.Н. Кардовского, «Переславль. Сто лет назад», «Грани войны», «Удивительный мир природы Залесского края»
Экскурсии: по музею, филиалам и городу: «Памятники архитектуры Горицкого монастыря», «Древнерусская живопись XVI-XIXвв.», «Серебряная кладовая», «Переславль. Сто лет назад», «Переславль – родина Александра Невского, всего 22 экскурсионных маршрута; есть специализированные экскурсии для разных возрастных категорий и для людей с ограничением здоровья.
Праздники: Рождество в музее (7 января), Сударыня Масленица (по церковному календарю), Ночь в музее (Всемирный день музеев), Фестиваль исторических клубов «Российскому флоту быть!» (последнее воскресенье июля), молодежный фестиваль «Пересечение», фестиваль искусств «Переславская осень».
Правила посещения: вход на территорию музея платный – 30 рублей. Билеты на экспозиции приобретаются в кассе у входа в музей. На территории музея и в залах разрешена бесплатная любительская фото- и видеосъемка (кроме выставок «Русское декоративно-прикладное искусство XVI-XIX вв.» (ризница)) и «Древнерусское искусство (иконы) XV-XVIII вв.», съемка в коммерческих целях – по согласованию с администрацией музея и отдельному договору.
Филиалы и отделы музея-заповедника: музей-усадьба «Ботик Петра I», музей «Усадьба Ганшиных», Спасо-Преображенский собор, Культурно-выставочный центр.